蛋白酶，顧名思義，降解蛋白的酶，是一種切割活性較廣的絲氨酸蛋白酶。它切割脂族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽鍵，用于生物樣品中蛋白質的一般降解。在RNA提取中，蛋白酶k的作用主要是降解RNA酶，防止RNA的降解。

　　蛋白酶K廣泛應用于分子生物學，藥理學等科研方面。一種非特異性、枯草桿菌蛋白酶相關的絲氨酸蛋白酶，具有很高的比活性。一般儲存在-20°C，避光防潮密閉干燥蛋白酶是所有能夠催化分解蛋白質的酶類的統稱

　　蛋白酶k是一種枯草蛋白酶類的高活性蛋白酶，從林伯氏白色念球菌中純化得到。該酶有兩個Ca2+結合位點，它們離酶的活性中心有一定距離，與催化機理并無直接關系。然而，如果從該酶中除去Ca2+，由于出現遠程的結構變化，催化活性將喪失80%左右，但其剩余活性通常已足以降解在一般情況下污染酶制品的蛋白質。所以，蛋白酶k消化過程中通常加入edta（以抑制依賴于mg2+的核酸酶的作用）。但是，如果要消化對蛋白酶k具有較強耐性的蛋白，如角蛋白一類，則可能需要使用含有1mmol/lCa2+而不含edta的緩沖液。在消化完畢后、純化核酸前要加入egt（ph8.0）至終濃度為2mmol/l，以鰲合Ca2+。